تربیت نسلی مؤمن با برجستگی‌های فکری، اخلاقی و رفتاری از آرمان‌های جمهوری اسلامی بوده و هست اما مسیر دستیابی به این هدف، طولانی و همراه با موانع متعدد است. بر اساس این دغدغه کارشناسان و هیئت مؤسس آموزشی و متخصصین تربیتی دبیرستان دخترانه شهید مطهری از سال 1393 مطالعات و طرح‌ریزی برای تأسیس دبستانی با رویکرد علوم و معارف اسلامی را آغاز نمودند تا ان‌شاءالله در حرکتی پیشرو و جهادی نمونه و الگویی عینی از نظام مطلوب تعلیم و تربیت ارائه دهند و مسیر تحقق نظام مطلوب تعلیم و تربیت را هرچه بیشتر روشن‌تر و هموارتر نمایند.

با عنایات و الطاف حضرت حق مطالعات و طرح‌ریزی‌ها به مرحله اجرا رسید و اولین دبستان علوم و معارف اسلامی ایران تحت‌نظر مدیریت دبیرستان علوم و معارف اسلامی دخترانه شهید مطهری در سال 1395 با نام «دبستان ولایت مطهر» تأسیس شد.